保稅港區(qū)無論是自由度還是開放度，都遠不如自由貿易港區(qū)。因為保稅港區(qū)僅享有優(yōu)惠的稅收政策，仍實行較嚴格的備案管理，手續(xù)簡化有限。為此，九三學社社員、上海海事大學教師方敏和肖鐘熙建議，將浦東航空港、洋山深水港與外高橋港區(qū)三港連成一片，建成浦東自由貿易港區(qū)。

　　方敏和肖鐘熙認為，貿易便利化加速要素跨境流通，降低貿易成本，是國際貿易的發(fā)展趨勢，也是國際貿易中的競爭手段。2010年，我國在世界貿易便利指數(shù)排名中排第48位，上海雖然在貿易便利化方面走在全國前列，但與發(fā)達經濟體相比仍有較大差距。

　　“設立自由貿易區(qū)是國際上通行的做法，可保證國際航運中心成為高度便利的平臺，使貨物流通過程中的手續(xù)最大限度地簡化，而且這些手續(xù)能夠無縫連接以加速貨物的流通與降低成本�！狈矫粽f，上�？诎锻赓Q貨物總值幾乎占全國外貿總額三分之一，通過三港的外貿貨物占上�？诎�85%以上。在通過上�？诎兜耐赓Q貨物中，中轉貨物在上海口岸占六成，表明上海建設自由貿易港區(qū)后受益地區(qū)多。此外，“屬地申報，口岸放行”的大通關方式目前已運用于三分之一外貿貨物，上海國際航運中心便利化建設已有相當基礎。上海三港在此方面還具有獨特優(yōu)勢，包括了空港、海港在內自由港區(qū)，將能實現(xiàn)海空聯(lián)運、空運中轉，很好滿足�？章�(lián)運攀升的需求。

　　不過，要一步到位建成自由貿易港區(qū)還有很大困難。方敏和肖鐘熙建議，上海需要按照《國務院關于推進上海加快發(fā)展現(xiàn)代服務業(yè)和先進制造業(yè)建設國際金融中心和國際航運中心的意見》精神，在建設“國際航運發(fā)展綜合試驗區(qū)”過程中加快功能建設。

　　他們提出，在試驗區(qū)中，除實行《意見》中提出的優(yōu)惠政策外，可把一些自由貿易港區(qū)的功能建設作為提高體制運行效率的創(chuàng)新舉措，在洋山港區(qū)“先行先試”，然后在外高橋港區(qū)與浦東航空港推行，把三港打造成在現(xiàn)行政策條件下開放度最高、貿易便利化程度最高的平臺，成為實質上的自由貿易港區(qū)。

　　他們還建議，根據(jù)《意見》中“探索創(chuàng)新海關特殊監(jiān)管區(qū)域的管理制度，更好地發(fā)揮洋山保稅港區(qū)的功能”的要求，除盡快落實啟運港退稅政策，還可在海關監(jiān)管制度上有所突破：如開辟綠色通道，保證海關在網上根據(jù)電子標簽提供的信息解決三港間自由移動；解決好國際中轉與�？罩修D過程中拆并箱問題；在港區(qū)內設立保稅倉庫為貨物在港區(qū)內進行加工提供方便等。